我院思想政治教育专业最早可追溯到1987年设置于南通师范专科学校政教系的思想政治教育（师范）三年制大专；1996年始与南京师范大学联合招收思想政治教育（师范）专业本科生；1999年南通师范专科学校升格为南通师范学院，开始独立招收本科生，学制四年，授予法学学士学位；2004年南通师范学院与南通医学院、南通工学院合并组建南通大学，本专业先后设置于法政学院（2004-2009年）、法政与管理学院（2009-2011年）、政治学院（2011-2015年）和马克思主义学院（2015年至今）。

截至目前，本专业在校本科生351人，年均招生规模近80人。现有专任教师78人。教授15人，副教授（含其他副高级职称）37人，高级职称占66.67%，专任教师中具有博士学位教师253，具有硕士学位教师24人，博士学位比例达到67.95%。本专业所在学院为江苏省高校示范马克思主义学院（2016-2022），所依托的学科“马克思主义理论”为江苏省重点学科、硕士学位一级学科授权点。现有11个教育教学实习基地，拥有智慧教室、心理健康教育实训室、远程教学观摩室、图书资料室、研究基地等专用设施和平台资源，各类教学经费满足办学需要。