南通大学马克思主义学院马克思主义理论学科获批一级学科硕士学位授权点（2017），入选江苏省“十四五”重点学科。本学科下设马克思主义基本原理、马克思主义中国化研究、思想政治教育和党的建设四个二级学科方向。

1.马克思主义基本原理下设三个培养方向：

（1）马克思主义哲学原理实践转化研究

（2）马克思主义政治经济学的当代发展研究

（3）马克思主义原理在各学科的运用研究

2.马克思主义中国化研究下设三个培养方向：

（1）中国特色区域发展协同创新研究

（2）中国特色社会主义理论、制度与经验研究

（3）马克思主义中国化前沿问题研究

3.思想政治教育下设三个培养方向：

（1）廉洁文化与廉洁育人研究

（2）思想政治教育原理与方法研究

（3）学校思想政治教育研究

4.党的建设下设三个培养方向：

（1）党风廉政建设研究

（2）党的理论武装与思想传播研究

（3）党内法规建设研究